Этим же распоряжением на ФГУП ОКБ ОТ РАН « возложено проведение поисковых научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ по проектированию, конструированию и изготовлению технических средств для фундаментальных исследований по физике, биологии, геологии и химии океана».

В соответствии постановлением Президиума Российской академии наук от 18 мая 1999 года, № 133 ОКБ ОТ присвоен статус Федерального Государственного Унитарного Предприятия (ФГУП ОКБ ОТ РАН) и утверждена новая редакция Устава от 18 августа 2000 г, зарегистрированного Юридическим отделом РАН, регистрационный номер 10123- 1312/778 от 17 августа 2000 г. и Московской регистрационной палатой, регистрационный номер 1666-у от 21 сентября 2000 г.

В ноябре 2001 года ФГУП ОКБ ОТ РАН получило государственную аккредитацию в соответствии с Федеральным законом «О науке и государственной научно-технической политике» (Свидетельство о государственной аккредитации научной организации № 3463 от 23.11.2001 г.).

В 2004 году в соответствии с постановлением Президиума Российской академии наук от 09.03. 2004, № 67 на ФГУП ОКБ ОТ РАН дополнительно возложено проведение технической экспертизы и сопровождение проектов перевооружения, модернизации, ремонта научно-технического оборудования научно-исследовательских судов РАН и проведение морских испытаний на судах РАН нового научно-исследовательского оборудования, в связи с чем утверждена новая редакция Устава от 29 апреля 2004 года с государственной регистрацией от 26 мая 2004 г.

За более чем 40-летнюю историю своей работы ОКБ ОТ РАН выполнило большое число научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ по созданию технологий, уникальных систем, приборов и оборудования широкого спектра назначения для фундаментальных и прикладных исследований Мирового океана, от измерительных датчиков морских параметров до комплексных систем и подводных обитаемых и необитаемых аппаратов.

Широко известны приборы, созданные в ОКБ ОТ РАН такие как, измерители течений серии « ПОТОК», подводные обитаемые аппараты «АРГУС», «ОСМОТР», «РИФТ», автономные исследовательские донные и буйковые станции «Флора», «СДС-М», «Мембрана», «АДСС-1», буксируемые и зондирующие гидрофизические системы «Гидра», «Аист», «Профиль», «Нырок», гидроакустические системы донной навигации «ГАНС», буксируемые гидроакустические и фототелевизионные комплексы «Локсодромия», «Звук» и другая уникальная научно-исследовательская океанологическая техника.

Являясь организацией Российской академии наук ОКБ ОТ РАН активно сотрудничает с рядом академических институтов и конструкторских бюро, высшими учебными заведениями.

Ежегодно ОКБ ОТ РАН выполняет задания РАН по НИР, ОКР и оснащению институтов и организаций РАН новыми океанологическими приборами, в первую очередь Институт океанологии им П.П. Ширшова РАН.

Так же ОКБ ОТ РАН выполняет совместные научно-исследовательские проекты, разрабатывает и поставляет приборы, выполняет морские научно-технические и инженерные морские работы в сотрудничестве и по заказам научных организаций других ведомств РФ, таких как МО, Мин. природных ресурсов, Российское агентство средств управления, ОАО «Газпром», и др.

ОКБ ОТ РАН участник государственных программ и проектов, в том числе: ФЦП «Мировой океан», ФЦП « Научное приборостроение», «Приборное оснащение полигонов сейсмоопасных районов России», «Исследовательский морской полигон в Черном море».

ОКБ ОТ РАН участник международных государственных проектов и программ:

• Российско-Индийская программа ILTP (Проекты «Глубоководный телеуправляемый аппарат», « Глубоководная исследовательская обсерватория», «Гидроакустическая система позиционирования буксируемых аппаратов», «Морские газогидраты»).
• Геоэкологические исследования в Центральной части Индийского океана, Мин. природных ресурсов.

ОКБ ОТ РАН активно сотрудничает с научными и конструкторскими зарубежными организациями США, Японии, Индии, Греции, Германии, Франции, Англии.

В числе зарубежных партнеров ОКБ ОТ РАН такие организации как, Университеты штатов Вашингтон и Флорида, США, Национальный институт океанографии, Национальный геофизический институт и Институт морских технологий Индии, Афинский университет, компании «Sound ocean systems», США, Reson (Дания), Sonardyne (Англия), и ряд других.

ОКБ ОТ РАН постоянный и активный участник российских и зарубежных конференций и выставок по научному приборостроению и морским технологиям.

На целый ряд разработок океанологической аппаратуры и оборудования ОКБ ОТ РАН имеет патенты.

В состав постоянно действующего Научно-технического Совета ОКБ ОТ РАН кроме ученых и ведущих специалистов ОКБ ОТ входят ученые РАН, ИО РАН, ИВП РАН.

Тематика Научно-технического Совета ОКБ ОТ РАН включает в себя:

• Перспективные направления научных и прикладных исследований в Мировом океане и их техническое обеспечение.

• Научно-технические и технологические аспекты создания приборов и систем нового поколения для исследований в Мировом океане, научные и инженерно-технические вопросы выполняемых ОКБ ОТ РАН НИР и ОКР.

• Вопросы организации и выполнения научно-технических проектов по тематикам ОКБ ОТ РАН.

• Методическое и техническое обеспечение научно-исследовательских работ на борту научно-исследовательских судов РАН в соответствии с планируемыми научными программами.

• Вопросы сотрудничества с ВУЗами по подготовке молодых специалистов в области инженерной океанологии.